В органах государственной безопасности Прокопюк работал с 1921 года, во внешней разведке – с 1935 года. В 1937-1938 годах выполнял специальные разведывательные задания в Испании, за что был награжден орденом Красного Знамени.
В годы Великой Отечественной войны был командиром отряда специального назначения «Охотники». Награжден орденом Ленина, вторым орденом Красного Знамени, двумя орденами Отечественной войны. После войны несколько лет возглавлял один из отделов советской военной администрации в Германии.
В 1950 году в звании полковника вышел в запас по болезни. Скончался в 1975 году.